随着抗生素滥用导致的细菌耐药性的产生、药物残留、环境危害等问题越发频繁，人们对动物性食品的要求越来越高，伴随着“健康养殖”观念的兴起，发酵饲料等能够平衡肠道微生态、提高机体免疫力的饲料逐渐有了广阔的前景。 
生物发酵饲料是通过高活性的有益微生物，比如乳酸菌、酵母菌、芽孢杆菌等对秸秆等常规饲料进行代谢环节的发酵处理，再按照比例加入定量的蛋白质、能量、维生素、矿物质和微量元素等进行复合而成。发酵饲料的作用：
一是把饲料中的较多难消化的物质如多糖、脂肪和蛋白质等大分子物质在各种菌类如纤维分解菌、半纤维分解菌、微生物酶等有益微生物制剂作用下，降解生成葡萄糖、有机酸、氨基酸、未知促生长因子、维生素、可溶性多肽等小分子营养物质。
二是降解粗纤维和木质素，通过微生物的作用将纤维素和半纤维素游离出来，增加了与消化液接触的机会，变成有生物活性的其他营养物质，从而提高了饲料的消化吸收率和营养价值。
三是通过微生物能使饲料中的抗营养因子、毒菌毒素等有害物质被破坏、分解，增加饲料中的有益的活菌存在量，提高饲料的适口性。
四是生物发酵饲料中的乳酸菌、酵母菌、芽孢杆菌等有益微生物通过产生乳酸、醋酸和丙酸等降低pH 值来抑制和杀灭病原菌， 对机体内微生物的生态平衡进行维持，对机体的免疫力进行提高，可抵抗病患。 
综上所述，相对于常规饲料，发酵饲料能显著降低料肉比，增强畜禽抗病力，提升动物产品品质的突出特点，是实施高效健康养殖的有效手段。